Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox12Q04890 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 CT025579.2-201ENSMUST00000225280 816 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox12Q04890 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms