Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Thbs2Q03350 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms