Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NfiaQ02780 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms