Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms