Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top2aQ01320 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms