Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EgfrQ01279 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EgfrQ01279 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms