Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SelpQ01102 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SelpQ01102 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SelpQ01102 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms