Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Grin2bQ01097 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms