Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rbp4Q00724 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms