Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Itga4Q00651 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms