Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms