Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Irx3P81067 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms