Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tp53bp1P70399 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms