Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfixP70257 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NfixP70257 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NfixP70257 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NfixP70257 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfixP70257 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfixP70257 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfixP70257 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfixP70257 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfixP70257 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfixP70257 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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NfixP70257 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfixP70257 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfixP70257 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfixP70257 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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NfixP70257 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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NfixP70257 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfixP70257 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfixP70257 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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NfixP70257 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfixP70257 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfixP70257 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfixP70257 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfixP70257 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfixP70257 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfixP70257 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NfixP70257 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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