Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp46P62069 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp46P62069 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp46P62069 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms