Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vbp1P61759 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vbp1P61759 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vbp1P61759 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vbp1P61759 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vbp1P61759 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vbp1P61759 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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