Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Csrnp3P59055 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csrnp3P59055 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csrnp3P59055 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csrnp3P59055 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csrnp3P59055 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csrnp3P59055 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csrnp3P59055 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Csrnp3P59055 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms