Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mmp20P57748 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mmp20P57748 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp20P57748 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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