Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
GferP56213 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GferP56213 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GferP56213 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GferP56213 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GferP56213 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GferP56213 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
GferP56213 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
GferP56213 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
GferP56213 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
GferP56213 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
GferP56213 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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