Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sh3bp1P55194 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Sh3bp1P55194 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp1P55194 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp1P55194 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp1P55194 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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Sh3bp1P55194 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sh3bp1P55194 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms