Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NcanP55066 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NcanP55066 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NcanP55066 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcanP55066 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcanP55066 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcanP55066 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NcanP55066 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NcanP55066 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms