Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rad23bP54728 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms