Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab2aP53994 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms