Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
FmodP50608 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
FmodP50608 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms