Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpbP50405 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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