Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfx1P48377 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfx1P48377 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfx1P48377 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfx1P48377 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rfx1P48377 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rfx1P48377 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rfx1P48377 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rfx1P48377 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx1P48377 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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