Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SrprbP47758 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SrprbP47758 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SrprbP47758 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SrprbP47758 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SrprbP47758 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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