Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cdkn1bP46414 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cdkn1bP46414 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms