Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Mmp9P41245 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mmp9P41245 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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