Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VhlP40338 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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VhlP40338 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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VhlP40338 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VhlP40338 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VhlP40338 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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