Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ThpoP40226 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ThpoP40226 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ThpoP40226 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms