Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hes1P35428 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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