Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NapbP28663 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NapbP28663 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NapbP28663 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NapbP28663 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms