Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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