Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ChgaP26339 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms