Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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