Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ggta1P23336 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ggta1P23336 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms