Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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SftpcP21841 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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SftpcP21841 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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SftpcP21841 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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SftpcP21841 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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