Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou5f1P20263 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms