Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P18532 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P18532 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P18532 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms