Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18528 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18528 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18528 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18528 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P18528 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18528 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
P18528 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18528 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18528 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18528 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18528 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18528 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P18528 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P18528 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms