Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Myod1P10085 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms