Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Becn2P0DM65 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms