Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
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PtprqP0C5E4 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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PtprqP0C5E4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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PtprqP0C5E4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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PtprqP0C5E4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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PtprqP0C5E4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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PtprqP0C5E4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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PtprqP0C5E4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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