Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms