Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxb7P09024 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms