Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgfb1P04202 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tgfb1P04202 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tgfb1P04202 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tgfb1P04202 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Tgfb1P04202 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgfb1P04202 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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