Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01820 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P01820 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01820 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01820 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P01820 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01820 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01820 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01820 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01820 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01820 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01820 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P01820 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P01820 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P01820 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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P01820 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P01820 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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P01820 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01820 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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