Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01648 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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P01648 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01648 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01648 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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