Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ComtO88587 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ComtO88587 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ComtO88587 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ComtO88587 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ComtO88587 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ComtO88587 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ComtO88587 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ComtO88587 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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ComtO88587 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ComtO88587 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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ComtO88587 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ComtO88587 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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ComtO88587 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ComtO88587 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms